Председатель суда - Андриенко Сергей Николаевич.
В настоящее время 1-му Восточному окружному военному суду подчинено 11 гарнизонных военных судов, дислоцированные в 5 субъектах Российской Федерации: Хабаровский край, Амурская область, Сахалинская область, Еврейская Автономная область, Республика Саха (Якутия).
В соответствии с Федеральным законом от 7 июня 2017 года № 115-ФЗ «О внесении изменений в уголовно-процессуальный кодекс Российской Федерации» юрисдикция 1-го Восточного окружного военного суда по рассмотрению уголовных дел террористической направленности распространилась на всей территории Сибири и Дальнего Востока (от Омской области до Камчатского края и Чукотского автономного округа).